サイクリン依存性キナーゼは、サイクリンとの結合によって正に制御され、阻害性サブユニットとの結合によって負に制御される。サイクリン依存性キナーゼの活性はリン酸化状態によっても制御されており、これはwee1キナーゼとCDC25ホスファターゼの拮抗作用によって制御されている。ヒト細胞には3つのCDC25遺伝子が存在する：CDC25A、CDC25B、CDC25Cである。これら3つの遺伝子は細胞周期の異なる段階で機能する。CDC25AとCDC25Bは細胞周期を通して発現するが、CDC25AはG1、CDC25BはG1-S期とG2の両方で発現のピークがあるのに対し、CDC25CはG2で主に発現する。