La Cdk5 è espressa sia nelle cellule cicliche che in quelle non cicliche ed è presente in numerosi tessuti dei mammiferi. Le cellule neuronali e muscolari contengono la maggior quantità di questa proteina. La proteina p35, espressa esclusivamente nel cervello, attiva la Cdk5. L'attività della Cdk5 è coinvolta nella differenziazione terminale dei neuroni e delle cellule muscolari.