La Cdk5 est exprimée à la fois dans les cellules cycliques et non cycliques et est présente dans de nombreux tissus de mammifères. Les cellules neuronales et musculaires contiennent la plus grande quantité de cette protéine. La protéine p35, qui n'est exprimée que dans le cerveau, active la Cdk5. L'activité de Cdk5 est impliquée dans la différenciation terminale des neurones et des cellules musculaires.