Pax-5 è una proteina attivatrice specifica delle cellule B (BSAP). Nelle prime fasi dello sviluppo delle cellule B, Pax-5 influenza l'espressione di diversi geni specifici delle cellule B, come CD19 e CD20. Pax-5 è espresso principalmente nelle cellule B pro-, pre- e mature, ma non nelle plasmacellule. Pax5 è espresso nella maggior parte dei tumori maligni delle cellule B (linfomi/leucemie a cellule B pre e mature). Oltre il 90% dei casi è positivo per Pax5 nel linfoma di Hodgkin, nel linfoma linfoplasmacitico, nel carcinoma a cellule di Merkel e nel carcinoma a piccole cellule. I linfomi a cellule T, il mieloma/plasmocitoma e i tumori carcinoidi sono negativi per Pax5.