Pax-5 es una proteína activadora específica de las células B (BSAP). En las primeras etapas del desarrollo de las células B, Pax-5 influye en la expresión de varios genes específicos de las células B, como CD19 y CD20. Pax-5 se expresa principalmente en células B pro-, pre- y maduras, pero no en células plasmáticas. Pax5 se expresa en la mayoría de las neoplasias de células B (linfomas/leucemias de células B pre-B y maduras). Más del 90% de los casos son positivos para Pax5 en el linfoma de Hodgkin, el linfoma linfoplasmocítico, el carcinoma de células de Merkel y el carcinoma de células pequeñas. Los linfomas de células T, el mieloma/plasmocitoma y los tumores carcinoides son negativos para Pax5.