ウェスタンブロッティングでは、Ab-3は哺乳類コラゲナーゼで消化した後のラチティックII型コラーゲンのTCAフラグメントと反応する。ペプシン消化II型コラーゲンとも反応する。コラーゲンIIのCNBrペプチドのイムノブロットは、MAb 6B3が無傷のII型分子に沿った免疫原性エピトープと関節炎エピトープの部位であるCB 11フラグメントと反応することを示している。ウェスタンブロット法（ELISA法ではない）では、Ab-3はα1(II)とα3(XI)鎖を認識する。