アデノウイルスゲノムの初期領域(E1A)は、細胞の形質転換や遺伝子発現の制御において中心的な役割を果たしている。E1A領域は多機能性を持つ一連の関連タンパク質（35-46kDa）をコードし、レチノブラストーマ腫瘍抑制遺伝子産物（Rbタンパク質）と特異的複合体を形成する。E1AとE1B領域はアデノウイルスの形質転換領域を構成している。初代細胞を不死化するにはE1Aの発現だけで十分であるが、完全な形質転換にはE1B領域の追加発現が必要である。E1Aのいくつかの保存領域は、HPV-16やHPV-18のE7やSV40ラージT抗原のような他のウイルスのオンコプロテインの一部と類似している。