Pax-5はB細胞特異的活性化タンパク質（BSAP）である。B細胞発生の初期段階において、Pax-5はCD19やCD20のようないくつかのB細胞特異的遺伝子の発現に影響を及ぼす。Pax-5は主にプロB細胞、プレB細胞、成熟B細胞で発現するが、形質細胞では発現しない。Pax5はほとんどのB細胞悪性腫瘍（プレB細胞および成熟B細胞リンパ腫/白血病）で発現している。ホジキンリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、メルケル細胞癌、小細胞癌では90％以上の症例でPax5が陽性である。T細胞リンパ腫、骨髄腫/形質細胞腫およびカルチノイド腫瘍はPax5陰性である。