Pax-5 ist ein B-Zell-spezifisches Aktivatorprotein (BSAP). In den frühen Stadien der B-Zell-Entwicklung beeinflusst Pax-5 die Expression mehrerer B-Zell-spezifischer Gene, wie CD19 und CD20. Pax-5 wird vor allem in pro-, prä- und reifen B-Zellen, nicht aber in Plasmazellen exprimiert. Pax-5 wird bei den meisten bösartigen B-Zell-Tumoren (Prä-B- und reife B-Zell-Lymphome/Leukämien) exprimiert. Über 90% der Fälle sind positiv für Pax5 bei Hodgkin-Lymphomen, lymphoplasmatischen Lymphomen, Merkelzell- und kleinzelligen Karzinomen. Bei T-Zell-Lymphomen, Myelomen/Plasmozytomen und Karzinoidtumoren ist Pax5 negativ.