La Cdk5 se expresa tanto en células cíclicas como no cíclicas y está presente en numerosos tejidos de mamíferos. Las células neuronales y musculares contienen la mayor cantidad de esta proteína. La proteína p35, que se expresa únicamente en el cerebro, activa la Cdk5. La actividad de Cdk5 está implicada en la diferenciación terminal de las neuronas y las células musculares.