La S100 appartiene alla famiglia delle proteine che legano il calcio, come la calmodulina e la troponina C. La S100A è composta da una catena alfa e beta, mentre la S100B è composta da due catene beta. La proteina S100 è espressa anche nelle cellule che presentano l'antigene, come le cellule di Langerhans nella pelle e le cellule del reticolo interdigitante nella paracorteccia dei linfonodi.