Pax-5 è una proteina attivatrice specifica delle cellule B (BSAP). Nelle prime fasi dello sviluppo delle cellule B, Pax-5 influenza l'espressione di diversi geni specifici delle cellule B, come CD19 e CD20. Pax-5 è espresso principalmente nelle cellule B pro-, pre- e mature, ma non nelle plasmacellule. È interessante notare che l'mRNA di Pax-5 viene rilevato transitoriamente nel mesencefalo e nel midollo spinale durante l'embriogenesi. L'espressione si sposta poi nel fegato fetale e si correla con l'inizio della linfopoiesi B. Ciò indica che Pax-5 è importante per le cellule B mature. Ciò indica che Pax-5 è importante nello sviluppo delle cellule B, ma potrebbe anche avere un ruolo nel corretto sviluppo neuronale.