Pax-5 ist ein B-Zell-spezifisches Aktivatorprotein (BSAP). In den frühen Stadien der B-Zell-Entwicklung beeinflusst Pax-5 die Expression mehrerer B-Zell-spezifischer Gene, wie CD19 und CD20. Pax-5 wird vor allem in pro-, prä- und reifen B-Zellen, nicht aber in Plasmazellen exprimiert. Interessanterweise wird Pax-5 mRNA während der Embryogenese vorübergehend im Mesencephalon und im Rückenmark nachgewiesen. Die Expression verlagert sich dann in die fetale Leber und korreliert mit dem Beginn der B-Lymphopoese. Dies deutet darauf hin, dass Pax-5 für die Entwicklung von B-Zellen wichtig ist, aber auch eine Rolle bei der korrekten neuronalen Entwicklung spielen könnte.