Pax-5 est une protéine activatrice spécifique des cellules B (BSAP). Dans les premiers stades du développement des cellules B, Pax-5 influence l'expression de plusieurs gènes spécifiques des cellules B, tels que CD19 et CD20. Pax-5 est exprimé principalement dans les cellules B pro-, pré- et matures, mais pas dans les plasmocytes. Il est intéressant de noter que l'ARNm de Pax-5 est détecté de manière transitoire dans le mésencéphale et la moelle épinière au cours de l'embryogenèse. L'expression se déplace ensuite vers le foie fœtal et est en corrélation avec le début de la lymphopoïèse B. Cela indique que Pax-5 est important dans le développement des cellules B, mais qu'il pourrait également jouer un rôle dans le développement neuronal.