La caudal-related homeodomain protein2 (CDX2) est un facteur de transcription qui joue un rôle dans le développement de l'intestin grêle et du gros intestin chez les mammifères et dans la différenciation des cellules épithéliales intestinales. Il a été démontré que la détection de la protéine CDX2 par IHC est en corrélation avec les niveaux de transcription de l'ARN. Dans des études portant sur 745 cancers provenant de nombreux sites anatomiques, les adénocarcinomes du côlon présentaient une forte coloration dans 90 % des cas, tandis que les adénocarcinomes de l'estomac, de l'œsophage et de l'ovaire ne présentaient une coloration étendue que dans 30 % des cas. Les colorations de CDX2 et de Villin sont des marqueurs utiles dans le diagnostic différentiel de l'adénocarcinome de la vessie et de l'adénocarcinome colorectal secondaire.